Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DmdP11531 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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DmdP11531 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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DmdP11531 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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DmdP11531 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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DmdP11531 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DmdP11531 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DmdP11531 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms