Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P10404 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P10404 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P10404 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P10404 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P10404 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P10404 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P10404 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms