Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxb4P10284 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms