Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp1O89090 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms