Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp4O70480 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms