Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms