Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Copb2O55029 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Copb2O55029 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copb2O55029 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms