Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Psmb10O35955 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psmb10O35955 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms