Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrt1O35449 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms