Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Eftud2O08810 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms