Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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MttpO08601 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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MttpO08601 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms