Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm4340L7N2C4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm4340L7N2C4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm4340L7N2C4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4340L7N2C4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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