Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vwa3bJ9JI28 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vwa3bJ9JI28 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms