Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gm2056J3QQ02 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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