Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm5849J3QPE5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm5849J3QPE5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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