Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm20795J3QP49 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm20795J3QP49 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm20795J3QP49 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20795J3QP49 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms