Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim22J3QP37 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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