Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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