Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm20830J3KML6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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