Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gp1ba-201ENSMUST00000055184 2710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Dennd1b-202ENSMUST00000168527 8206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Zcchc12-201ENSMUST00000048067 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms