Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syngap1F6SEU4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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