Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf4E9QAP7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf4E9QAP7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms