Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85cE9Q6B2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms