Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fndc1E9Q043 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms