Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx60E9PZQ1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms