Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brd1E9PZ26 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms