Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Srp54bE9PXC0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp54bE9PXC0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms