Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms