Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Syde2E9PUP1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syde2E9PUP1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms