Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SafbD3YXK2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms