Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms