Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syce3B5KM66 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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