Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Usf3B2RUQ2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Usf3B2RUQ2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms