Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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