Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rrn3B2RS91 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms