Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms