Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem238A9JSM3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms