Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbp4A4UUI3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbp4A4UUI3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms