Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Atp8b5A3FIN4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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