Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rtf1A2AQ19 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rtf1A2AQ19 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rtf1A2AQ19 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms