Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GabreA2AMW3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GabreA2AMW3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GabreA2AMW3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms