Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp8nlA2ABX0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms