Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Speer3W4VSP1 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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