Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Hdac6Q9Z2V5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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