Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms