Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn7Q9Z261 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn7Q9Z261 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms