Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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Cldn8Q9Z260 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn8Q9Z260 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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