Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RfxankQ9Z205 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms