Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ilf3Q9Z1X4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ilf3Q9Z1X4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ilf3Q9Z1X4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ilf3Q9Z1X4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ilf3Q9Z1X4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ilf3Q9Z1X4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ilf3Q9Z1X4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ilf3Q9Z1X4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ilf3Q9Z1X4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ilf3Q9Z1X4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ilf3Q9Z1X4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ilf3Q9Z1X4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ilf3Q9Z1X4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ilf3Q9Z1X4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ilf3Q9Z1X4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms