Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms